Hay otra herramienta que tiene una pinta muy buena (aunque todavía no he tenido tiempo de probarla): Gaudí es una utilidad que permite editar visualmente la estructura de una base de datos, editar los datos de la tablas y exportar e importar los datos en formato XML (lo que parece ser un buen sistema para realizar migraciones entre distintos motores de base de datos.)

Por otro lado, he encontrado un estupendo catálogo de bases de datos en Java. Incluye motores, herramientas, librerías, drivers, bases de datos relacionales, bases de datos de objeto, bases de datos XML, y un muy largo etcétera. El sitio, Java Skyline, incluye también otros catálogos muy interesantes de recursos Java relacionados con aplicaciones web, arquitectura, etc.